Partnerství se projevuje v koordinaci některých aktivit, např. soustředění studentů. Ing. Daniel Fajfr, M.Th. působí na obou institucích.

Vzájemná dohoda umožňuje absolventům ETS pokračovat návazným studiem v Leuven (Belgie).

ETS využívá on-line databáze knihovny FTS (Pasedina, CA, USA).

Vzájemná dohoda umožňuje absolventům ETS dostudovat dálkově bakalářský program HTC (Dingwall, Skotsko).

ETS je partnerem projektu křesťanské univerzity, spolupodílí se na přípravách akreditovaných oborů a organizačního zajištění.

Mezinárodní baptistický teologický seminář, IBTS, se sídlem v Praze.

Dohoda mezi ETS a IBTS upravuje podmínky užívání knihovny IBTS studenty ETS a také podmínky přijímání absolventů ETS do studijních programů.

Vzájemná dohoda upravuje podmínky studia absolventů ETS ve studijních programech JU-TF. Této možnosti již využilo několik absolventů ETS v oboru pastorace, např. Mgr. Petra Kubečková, DiS..

Děkan JU-TF pan Tomáš Machula PhD., ThD. o absolventech ETS napsal: “Vzhledem k velmi dobrým zkušenostem s absolventy pastoračního oboru ETS, kteří na naší fakultě již studovali, a vzhledem ke kvalitě ETS jako školy, o které jsem přesvědčen na základě seznámení se s pedagogy, studijními programy i technickým zázemím školy, mohu do budoucna za naši Teologickou fakultu garantovat velkou otevřenost a vůli k další těsnější spolupráci jak v oblasti studia, tak v oblasti badatelské.”

Spolupráce spočívá ve vzájemných kontaktech, hostovských přednáškách (např. Jay Phelan v ČR v září 2009, Mgr. Viktor Ber, Th.D. v USA v září 2010).

Partnerství spočívá v koordinaci některých aktivit.

Řada absolventů ETS pokračovala na UK ETF magisterským studiem. Obě školy také uskutečňují společný bakalářský program sociální práce (více v sekci Obory). Někteří učitelé ETS již dokončili doktorský program na UK ETF, např. Karel Taschner, Th.D., ThDr. Pavel Černý, Th.D., Mgr. David Javornický, Th.D., doc. Pavel Hošek, Th.D., Mgr. Viktor Ber, Th.D., Mgr. Peter Cimala, Th.D.,DiS. nebo Jan Valeš, Th.D.. Pavel Hošek v současnosti působí na obou institucích zároveň.

Partnerství spočívá ve vzájemných kontaktech a hostovských přednáškách (např. na konferenci v roce 2008). Někteří vyučující působí na obou školách, např. doc. PhDr. Slavomír Krupa, Ph.D., prof. ThDr. Ján Liguš, Ph.D..

Partnerství spočívá v koordinaci některých aktivit a spolupráci ve Sdružení evangelikálních teologů.